Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rbp4Q00724 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rbp4Q00724 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Rbp4Q00724 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rbp4Q00724 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rbp4Q00724 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rbp4Q00724 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Rbp4Q00724 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rbp4Q00724 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rbp4Q00724 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rbp4Q00724 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rbp4Q00724 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Rbp4Q00724 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rbp4Q00724 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rbp4Q00724 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rbp4Q00724 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rbp4Q00724 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rbp4Q00724 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rbp4Q00724 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rbp4Q00724 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rbp4Q00724 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rbp4Q00724 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rbp4Q00724 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Rbp4Q00724 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rbp4Q00724 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rbp4Q00724 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rbp4Q00724 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rbp4Q00724 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rbp4Q00724 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rbp4Q00724 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rbp4Q00724 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rbp4Q00724 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rbp4Q00724 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rbp4Q00724 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rbp4Q00724 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rbp4Q00724 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rbp4Q00724 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rbp4Q00724 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rbp4Q00724 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rbp4Q00724 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rbp4Q00724 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rbp4Q00724 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rbp4Q00724 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rbp4Q00724 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rbp4Q00724 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rbp4Q00724 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rbp4Q00724 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rbp4Q00724 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
Rbp4Q00724 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rbp4Q00724 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rbp4Q00724 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rbp4Q00724 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Rbp4Q00724 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rbp4Q00724 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rbp4Q00724 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rbp4Q00724 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rbp4Q00724 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rbp4Q00724 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rbp4Q00724 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rbp4Q00724 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rbp4Q00724 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rbp4Q00724 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rbp4Q00724 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rbp4Q00724 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rbp4Q00724 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rbp4Q00724 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rbp4Q00724 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rbp4Q00724 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rbp4Q00724 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rbp4Q00724 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rbp4Q00724 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rbp4Q00724 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rbp4Q00724 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rbp4Q00724 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rbp4Q00724 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rbp4Q00724 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rbp4Q00724 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rbp4Q00724 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rbp4Q00724 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rbp4Q00724 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rbp4Q00724 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rbp4Q00724 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rbp4Q00724 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rbp4Q00724 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rbp4Q00724 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rbp4Q00724 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rbp4Q00724 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rbp4Q00724 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rbp4Q00724 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rbp4Q00724 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rbp4Q00724 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rbp4Q00724 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rbp4Q00724 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rbp4Q00724 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rbp4Q00724 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rbp4Q00724 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rbp4Q00724 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rbp4Q00724 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rbp4Q00724 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rbp4Q00724 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms