Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rbp4Q00724 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rbp4Q00724 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Rbp4Q00724 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rbp4Q00724 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rbp4Q00724 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rbp4Q00724 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Rbp4Q00724 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rbp4Q00724 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rbp4Q00724 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rbp4Q00724 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rbp4Q00724 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Rbp4Q00724 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rbp4Q00724 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rbp4Q00724 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rbp4Q00724 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rbp4Q00724 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rbp4Q00724 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rbp4Q00724 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rbp4Q00724 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rbp4Q00724 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rbp4Q00724 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rbp4Q00724 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Rbp4Q00724 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rbp4Q00724 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rbp4Q00724 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rbp4Q00724 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rbp4Q00724 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rbp4Q00724 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rbp4Q00724 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rbp4Q00724 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rbp4Q00724 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rbp4Q00724 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rbp4Q00724 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rbp4Q00724 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rbp4Q00724 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rbp4Q00724 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rbp4Q00724 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rbp4Q00724 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rbp4Q00724 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rbp4Q00724 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rbp4Q00724 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rbp4Q00724 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rbp4Q00724 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rbp4Q00724 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rbp4Q00724 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rbp4Q00724 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rbp4Q00724 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
Rbp4Q00724 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rbp4Q00724 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rbp4Q00724 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rbp4Q00724 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Rbp4Q00724 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rbp4Q00724 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rbp4Q00724 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rbp4Q00724 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rbp4Q00724 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rbp4Q00724 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rbp4Q00724 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rbp4Q00724 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rbp4Q00724 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rbp4Q00724 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rbp4Q00724 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rbp4Q00724 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rbp4Q00724 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rbp4Q00724 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rbp4Q00724 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rbp4Q00724 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rbp4Q00724 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rbp4Q00724 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rbp4Q00724 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rbp4Q00724 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rbp4Q00724 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rbp4Q00724 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rbp4Q00724 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rbp4Q00724 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rbp4Q00724 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rbp4Q00724 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rbp4Q00724 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rbp4Q00724 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rbp4Q00724 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rbp4Q00724 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rbp4Q00724 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rbp4Q00724 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rbp4Q00724 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rbp4Q00724 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rbp4Q00724 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rbp4Q00724 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rbp4Q00724 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rbp4Q00724 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rbp4Q00724 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rbp4Q00724 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rbp4Q00724 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rbp4Q00724 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rbp4Q00724 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rbp4Q00724 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rbp4Q00724 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rbp4Q00724 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rbp4Q00724 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rbp4Q00724 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms