Protein–RNA interactions for Protein: Q00342

Flt3, Receptor-type tyrosine-protein kinase FLT3, mousemouse

Predictions only

Length 1,000 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Flt3Q00342 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Flt3Q00342 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Flt3Q00342 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Flt3Q00342 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Flt3Q00342 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Flt3Q00342 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Flt3Q00342 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Flt3Q00342 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Flt3Q00342 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Flt3Q00342 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Flt3Q00342 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Flt3Q00342 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Flt3Q00342 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Flt3Q00342 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Flt3Q00342 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Flt3Q00342 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Flt3Q00342 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Flt3Q00342 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Flt3Q00342 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Flt3Q00342 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Flt3Q00342 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Flt3Q00342 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Flt3Q00342 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Flt3Q00342 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Flt3Q00342 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Flt3Q00342 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Flt3Q00342 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Flt3Q00342 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Flt3Q00342 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Flt3Q00342 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Flt3Q00342 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Flt3Q00342 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Flt3Q00342 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Flt3Q00342 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Flt3Q00342 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Flt3Q00342 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Flt3Q00342 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Flt3Q00342 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Flt3Q00342 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Flt3Q00342 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Flt3Q00342 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Flt3Q00342 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Flt3Q00342 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Flt3Q00342 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Flt3Q00342 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Flt3Q00342 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Flt3Q00342 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Flt3Q00342 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Flt3Q00342 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Flt3Q00342 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Flt3Q00342 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Flt3Q00342 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Flt3Q00342 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Flt3Q00342 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Flt3Q00342 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Flt3Q00342 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Flt3Q00342 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Flt3Q00342 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Flt3Q00342 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Flt3Q00342 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Flt3Q00342 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Flt3Q00342 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Flt3Q00342 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Flt3Q00342 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Flt3Q00342 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Flt3Q00342 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Flt3Q00342 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Flt3Q00342 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Flt3Q00342 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Flt3Q00342 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Flt3Q00342 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Flt3Q00342 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Flt3Q00342 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Flt3Q00342 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Flt3Q00342 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Flt3Q00342 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Flt3Q00342 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Flt3Q00342 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Flt3Q00342 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Flt3Q00342 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Flt3Q00342 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Flt3Q00342 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Flt3Q00342 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Flt3Q00342 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Flt3Q00342 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Flt3Q00342 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Flt3Q00342 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Flt3Q00342 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Flt3Q00342 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Flt3Q00342 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Flt3Q00342 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Flt3Q00342 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Flt3Q00342 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Flt3Q00342 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Flt3Q00342 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Flt3Q00342 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Flt3Q00342 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Flt3Q00342 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Flt3Q00342 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Flt3Q00342 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms