Protein–RNA interactions for Protein: P70697

Urod, Uroporphyrinogen decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UrodP70697 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UrodP70697 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UrodP70697 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UrodP70697 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UrodP70697 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UrodP70697 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UrodP70697 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
UrodP70697 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UrodP70697 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
UrodP70697 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
UrodP70697 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
UrodP70697 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UrodP70697 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UrodP70697 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UrodP70697 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UrodP70697 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
UrodP70697 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
UrodP70697 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UrodP70697 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UrodP70697 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UrodP70697 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UrodP70697 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UrodP70697 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
UrodP70697 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UrodP70697 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UrodP70697 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UrodP70697 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UrodP70697 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UrodP70697 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UrodP70697 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UrodP70697 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UrodP70697 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UrodP70697 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UrodP70697 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UrodP70697 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UrodP70697 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UrodP70697 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UrodP70697 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UrodP70697 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UrodP70697 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UrodP70697 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
UrodP70697 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UrodP70697 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UrodP70697 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
UrodP70697 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UrodP70697 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UrodP70697 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UrodP70697 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UrodP70697 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UrodP70697 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UrodP70697 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UrodP70697 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UrodP70697 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UrodP70697 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UrodP70697 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UrodP70697 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UrodP70697 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UrodP70697 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UrodP70697 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UrodP70697 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UrodP70697 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UrodP70697 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UrodP70697 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UrodP70697 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UrodP70697 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UrodP70697 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UrodP70697 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UrodP70697 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UrodP70697 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UrodP70697 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UrodP70697 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UrodP70697 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UrodP70697 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UrodP70697 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
UrodP70697 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UrodP70697 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UrodP70697 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UrodP70697 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UrodP70697 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UrodP70697 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UrodP70697 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UrodP70697 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UrodP70697 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UrodP70697 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UrodP70697 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UrodP70697 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UrodP70697 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UrodP70697 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UrodP70697 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UrodP70697 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UrodP70697 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UrodP70697 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UrodP70697 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UrodP70697 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UrodP70697 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UrodP70697 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UrodP70697 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UrodP70697 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
UrodP70697 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
UrodP70697 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms