Protein–RNA interactions for Protein: P62192

Psmc1, 26S proteasome regulatory subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmc1P62192 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Psmc1P62192 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Psmc1P62192 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Psmc1P62192 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Psmc1P62192 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Psmc1P62192 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Psmc1P62192 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Psmc1P62192 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Psmc1P62192 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Psmc1P62192 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Psmc1P62192 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Psmc1P62192 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Psmc1P62192 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Psmc1P62192 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Psmc1P62192 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Psmc1P62192 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Psmc1P62192 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Psmc1P62192 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Psmc1P62192 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Psmc1P62192 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Psmc1P62192 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Psmc1P62192 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Psmc1P62192 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Psmc1P62192 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Psmc1P62192 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Psmc1P62192 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Psmc1P62192 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Psmc1P62192 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Psmc1P62192 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Psmc1P62192 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Psmc1P62192 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Psmc1P62192 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Psmc1P62192 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Psmc1P62192 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Psmc1P62192 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Psmc1P62192 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Psmc1P62192 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Psmc1P62192 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Psmc1P62192 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Psmc1P62192 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Psmc1P62192 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Psmc1P62192 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Psmc1P62192 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Psmc1P62192 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Psmc1P62192 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Psmc1P62192 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Psmc1P62192 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Psmc1P62192 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Psmc1P62192 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Psmc1P62192 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Psmc1P62192 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Psmc1P62192 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Psmc1P62192 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Psmc1P62192 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Psmc1P62192 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Psmc1P62192 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Psmc1P62192 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Psmc1P62192 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Psmc1P62192 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Psmc1P62192 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Psmc1P62192 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Psmc1P62192 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Psmc1P62192 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Psmc1P62192 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Psmc1P62192 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Psmc1P62192 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Psmc1P62192 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Psmc1P62192 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Psmc1P62192 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Psmc1P62192 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Psmc1P62192 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Psmc1P62192 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Psmc1P62192 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Psmc1P62192 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Psmc1P62192 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Psmc1P62192 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Psmc1P62192 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Psmc1P62192 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Psmc1P62192 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Psmc1P62192 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Psmc1P62192 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Psmc1P62192 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Psmc1P62192 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Psmc1P62192 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Psmc1P62192 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Psmc1P62192 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Psmc1P62192 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Psmc1P62192 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Psmc1P62192 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Psmc1P62192 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Psmc1P62192 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Psmc1P62192 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Psmc1P62192 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Psmc1P62192 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Psmc1P62192 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Psmc1P62192 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Psmc1P62192 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Psmc1P62192 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Psmc1P62192 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Psmc1P62192 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms