Protein–RNA interactions for Protein: P61205

Arf3, ADP-ribosylation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf3P61205 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Arf3P61205 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Arf3P61205 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Arf3P61205 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Arf3P61205 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Arf3P61205 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Arf3P61205 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Arf3P61205 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Arf3P61205 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Arf3P61205 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Arf3P61205 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Arf3P61205 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Arf3P61205 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Arf3P61205 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Arf3P61205 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Arf3P61205 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Arf3P61205 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Arf3P61205 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Arf3P61205 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Arf3P61205 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Arf3P61205 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Arf3P61205 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Arf3P61205 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Arf3P61205 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Arf3P61205 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Arf3P61205 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Arf3P61205 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Arf3P61205 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Arf3P61205 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Arf3P61205 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Arf3P61205 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Arf3P61205 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Arf3P61205 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Arf3P61205 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Arf3P61205 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Arf3P61205 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Arf3P61205 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Arf3P61205 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Arf3P61205 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Arf3P61205 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Arf3P61205 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Arf3P61205 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Arf3P61205 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Arf3P61205 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Arf3P61205 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Arf3P61205 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Arf3P61205 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Arf3P61205 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Arf3P61205 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Arf3P61205 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Arf3P61205 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Arf3P61205 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Arf3P61205 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Arf3P61205 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Arf3P61205 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Arf3P61205 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Arf3P61205 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Arf3P61205 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Arf3P61205 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Arf3P61205 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Arf3P61205 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Arf3P61205 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Arf3P61205 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Arf3P61205 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Arf3P61205 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Arf3P61205 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Arf3P61205 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Arf3P61205 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Arf3P61205 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Arf3P61205 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Arf3P61205 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Arf3P61205 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Arf3P61205 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Arf3P61205 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Arf3P61205 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Arf3P61205 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Arf3P61205 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Arf3P61205 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Arf3P61205 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Arf3P61205 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Arf3P61205 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Arf3P61205 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Arf3P61205 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Arf3P61205 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Arf3P61205 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Arf3P61205 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Arf3P61205 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Arf3P61205 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Arf3P61205 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Arf3P61205 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arf3P61205 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arf3P61205 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arf3P61205 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Arf3P61205 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arf3P61205 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Arf3P61205 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Arf3P61205 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Arf3P61205 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arf3P61205 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arf3P61205 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms