Protein–RNA interactions for Protein: P59222

Scarf2, Scavenger receptor class F member 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf2P59222 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,57■■□□□ 1,52
Scarf2P59222 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,57■■□□□ 1,52
Scarf2P59222 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,57■■□□□ 1,52
Scarf2P59222 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,57■■□□□ 1,52
Scarf2P59222 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,57■■□□□ 1,52
Scarf2P59222 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24,57■■□□□ 1,52
Scarf2P59222 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,56■■□□□ 1,52
Scarf2P59222 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24,56■■□□□ 1,52
Scarf2P59222 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,56■■□□□ 1,52
Scarf2P59222 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,56■■□□□ 1,52
Scarf2P59222 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24,56■■□□□ 1,52
Scarf2P59222 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24,56■■□□□ 1,52
Scarf2P59222 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,56■■□□□ 1,52
Scarf2P59222 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,56■■□□□ 1,52
Scarf2P59222 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24,56■■□□□ 1,52
Scarf2P59222 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,55■■□□□ 1,52
Scarf2P59222 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,55■■□□□ 1,52
Scarf2P59222 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,55■■□□□ 1,52
Scarf2P59222 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,55■■□□□ 1,52
Scarf2P59222 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,54■■□□□ 1,52
Scarf2P59222 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24,54■■□□□ 1,52
Scarf2P59222 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,54■■□□□ 1,52
Scarf2P59222 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24,54■■□□□ 1,52
Scarf2P59222 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,53■■□□□ 1,52
Scarf2P59222 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24,53■■□□□ 1,52
Scarf2P59222 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,53■■□□□ 1,52
Scarf2P59222 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24,53■■□□□ 1,52
Scarf2P59222 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,53■■□□□ 1,52
Scarf2P59222 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,52■■□□□ 1,52
Scarf2P59222 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,52■■□□□ 1,52
Scarf2P59222 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,52■■□□□ 1,52
Scarf2P59222 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24,52■■□□□ 1,52
Scarf2P59222 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24,52■■□□□ 1,52
Scarf2P59222 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,52■■□□□ 1,52
Scarf2P59222 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,52■■□□□ 1,52
Scarf2P59222 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,51■■□□□ 1,51
Scarf2P59222 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,51■■□□□ 1,51
Scarf2P59222 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24,51■■□□□ 1,51
Scarf2P59222 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24,51■■□□□ 1,51
Scarf2P59222 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,51■■□□□ 1,51
Scarf2P59222 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24,5■■□□□ 1,51
Scarf2P59222 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,49■■□□□ 1,51
Scarf2P59222 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,49■■□□□ 1,51
Scarf2P59222 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24,49■■□□□ 1,51
Scarf2P59222 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24,49■■□□□ 1,51
Scarf2P59222 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,49■■□□□ 1,51
Scarf2P59222 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24,49■■□□□ 1,51
Scarf2P59222 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,49■■□□□ 1,51
Scarf2P59222 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24,49■■□□□ 1,51
Scarf2P59222 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24,49■■□□□ 1,51
Scarf2P59222 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,49■■□□□ 1,51
Scarf2P59222 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24,48■■□□□ 1,51
Scarf2P59222 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24,48■■□□□ 1,51
Scarf2P59222 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24,48■■□□□ 1,51
Scarf2P59222 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24,48■■□□□ 1,51
Scarf2P59222 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24,48■■□□□ 1,51
Scarf2P59222 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,47■■□□□ 1,51
Scarf2P59222 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,47■■□□□ 1,51
Scarf2P59222 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24,47■■□□□ 1,51
Scarf2P59222 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,47■■□□□ 1,51
Scarf2P59222 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,47■■□□□ 1,51
Scarf2P59222 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24,46■■□□□ 1,51
Scarf2P59222 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,46■■□□□ 1,51
Scarf2P59222 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24,46■■□□□ 1,51
Scarf2P59222 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24,46■■□□□ 1,51
Scarf2P59222 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,46■■□□□ 1,51
Scarf2P59222 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,45■■□□□ 1,51
Scarf2P59222 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24,45■■□□□ 1,5
Scarf2P59222 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24,45■■□□□ 1,5
Scarf2P59222 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24,45■■□□□ 1,5
Scarf2P59222 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24,45■■□□□ 1,5
Scarf2P59222 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,45■■□□□ 1,5
Scarf2P59222 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,44■■□□□ 1,5
Scarf2P59222 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,44■■□□□ 1,5
Scarf2P59222 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,44■■□□□ 1,5
Scarf2P59222 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24,44■■□□□ 1,5
Scarf2P59222 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,43■■□□□ 1,5
Scarf2P59222 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24,43■■□□□ 1,5
Scarf2P59222 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,43■■□□□ 1,5
Scarf2P59222 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,42■■□□□ 1,5
Scarf2P59222 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24,42■■□□□ 1,5
Scarf2P59222 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,42■■□□□ 1,5
Scarf2P59222 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24,42■■□□□ 1,5
Scarf2P59222 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24,42■■□□□ 1,5
Scarf2P59222 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24,42■■□□□ 1,5
Scarf2P59222 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24,41■■□□□ 1,5
Scarf2P59222 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,41■■□□□ 1,5
Scarf2P59222 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,4■■□□□ 1,5
Scarf2P59222 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,39■■□□□ 1,49
Scarf2P59222 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24,39■■□□□ 1,49
Scarf2P59222 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24,39■■□□□ 1,49
Scarf2P59222 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,39■■□□□ 1,49
Scarf2P59222 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24,39■■□□□ 1,49
Scarf2P59222 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,38■■□□□ 1,49
Scarf2P59222 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,38■■□□□ 1,49
Scarf2P59222 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,38■■□□□ 1,49
Scarf2P59222 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24,38■■□□□ 1,49
Scarf2P59222 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24,37■■□□□ 1,49
Scarf2P59222 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,37■■□□□ 1,49
Scarf2P59222 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,37■■□□□ 1,49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,5 ms