Protein–RNA interactions for Protein: P49615

Cdk5, Cyclin-dependent-like kinase 5, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5P49615 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cdk5P49615 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cdk5P49615 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cdk5P49615 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cdk5P49615 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cdk5P49615 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cdk5P49615 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cdk5P49615 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cdk5P49615 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cdk5P49615 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cdk5P49615 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cdk5P49615 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cdk5P49615 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cdk5P49615 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cdk5P49615 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cdk5P49615 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cdk5P49615 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cdk5P49615 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cdk5P49615 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cdk5P49615 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdk5P49615 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdk5P49615 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdk5P49615 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdk5P49615 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdk5P49615 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdk5P49615 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdk5P49615 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cdk5P49615 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cdk5P49615 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cdk5P49615 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cdk5P49615 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cdk5P49615 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cdk5P49615 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdk5P49615 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdk5P49615 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdk5P49615 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdk5P49615 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdk5P49615 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdk5P49615 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdk5P49615 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdk5P49615 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdk5P49615 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdk5P49615 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdk5P49615 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdk5P49615 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdk5P49615 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdk5P49615 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdk5P49615 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdk5P49615 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdk5P49615 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdk5P49615 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdk5P49615 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdk5P49615 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdk5P49615 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdk5P49615 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdk5P49615 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdk5P49615 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdk5P49615 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdk5P49615 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdk5P49615 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdk5P49615 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdk5P49615 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdk5P49615 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdk5P49615 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdk5P49615 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdk5P49615 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdk5P49615 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdk5P49615 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdk5P49615 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdk5P49615 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdk5P49615 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdk5P49615 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdk5P49615 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdk5P49615 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdk5P49615 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdk5P49615 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdk5P49615 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdk5P49615 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdk5P49615 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdk5P49615 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdk5P49615 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdk5P49615 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdk5P49615 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdk5P49615 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdk5P49615 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cdk5P49615 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cdk5P49615 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cdk5P49615 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cdk5P49615 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cdk5P49615 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cdk5P49615 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cdk5P49615 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cdk5P49615 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cdk5P49615 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cdk5P49615 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cdk5P49615 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cdk5P49615 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cdk5P49615 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cdk5P49615 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cdk5P49615 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 139 ms