Protein–RNA interactions for Protein: P47774

Ccr7, C-C chemokine receptor type 7, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr7P47774 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccr7P47774 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccr7P47774 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccr7P47774 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccr7P47774 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccr7P47774 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccr7P47774 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccr7P47774 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccr7P47774 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccr7P47774 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccr7P47774 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccr7P47774 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccr7P47774 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccr7P47774 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccr7P47774 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccr7P47774 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccr7P47774 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccr7P47774 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccr7P47774 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccr7P47774 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccr7P47774 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccr7P47774 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccr7P47774 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccr7P47774 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccr7P47774 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccr7P47774 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccr7P47774 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccr7P47774 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccr7P47774 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccr7P47774 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccr7P47774 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccr7P47774 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccr7P47774 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccr7P47774 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccr7P47774 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccr7P47774 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccr7P47774 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccr7P47774 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccr7P47774 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccr7P47774 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccr7P47774 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccr7P47774 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccr7P47774 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccr7P47774 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccr7P47774 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccr7P47774 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccr7P47774 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccr7P47774 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccr7P47774 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccr7P47774 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccr7P47774 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccr7P47774 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccr7P47774 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccr7P47774 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccr7P47774 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccr7P47774 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccr7P47774 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccr7P47774 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccr7P47774 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccr7P47774 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccr7P47774 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccr7P47774 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccr7P47774 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccr7P47774 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccr7P47774 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccr7P47774 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccr7P47774 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccr7P47774 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccr7P47774 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccr7P47774 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccr7P47774 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccr7P47774 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccr7P47774 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccr7P47774 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccr7P47774 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccr7P47774 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccr7P47774 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccr7P47774 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccr7P47774 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccr7P47774 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccr7P47774 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccr7P47774 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccr7P47774 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccr7P47774 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccr7P47774 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccr7P47774 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccr7P47774 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccr7P47774 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccr7P47774 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccr7P47774 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccr7P47774 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccr7P47774 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccr7P47774 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccr7P47774 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccr7P47774 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccr7P47774 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccr7P47774 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccr7P47774 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccr7P47774 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccr7P47774 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms