Protein–RNA interactions for Protein: P41158

Elk4, ETS domain-containing protein Elk-4, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elk4P41158 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Elk4P41158 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Elk4P41158 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Elk4P41158 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Elk4P41158 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Elk4P41158 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Elk4P41158 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Elk4P41158 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Elk4P41158 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Elk4P41158 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Elk4P41158 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Elk4P41158 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Elk4P41158 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Elk4P41158 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Elk4P41158 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Elk4P41158 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Elk4P41158 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Elk4P41158 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Elk4P41158 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Elk4P41158 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Elk4P41158 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Elk4P41158 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Elk4P41158 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Elk4P41158 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Elk4P41158 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Elk4P41158 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Elk4P41158 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Elk4P41158 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Elk4P41158 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Elk4P41158 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Elk4P41158 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Elk4P41158 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Elk4P41158 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Elk4P41158 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Elk4P41158 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Elk4P41158 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Elk4P41158 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Elk4P41158 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Elk4P41158 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Elk4P41158 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Elk4P41158 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Elk4P41158 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Elk4P41158 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Elk4P41158 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Elk4P41158 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Elk4P41158 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Elk4P41158 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Elk4P41158 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Elk4P41158 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Elk4P41158 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Elk4P41158 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Elk4P41158 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Elk4P41158 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Elk4P41158 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Elk4P41158 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Elk4P41158 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Elk4P41158 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Elk4P41158 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Elk4P41158 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Elk4P41158 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Elk4P41158 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Elk4P41158 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Elk4P41158 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Elk4P41158 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Elk4P41158 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Elk4P41158 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Elk4P41158 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Elk4P41158 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Elk4P41158 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Elk4P41158 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Elk4P41158 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Elk4P41158 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Elk4P41158 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Elk4P41158 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Elk4P41158 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Elk4P41158 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Elk4P41158 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Elk4P41158 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Elk4P41158 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Elk4P41158 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Elk4P41158 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Elk4P41158 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Elk4P41158 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Elk4P41158 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Elk4P41158 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Elk4P41158 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Elk4P41158 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Elk4P41158 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Elk4P41158 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Elk4P41158 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Elk4P41158 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Elk4P41158 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Elk4P41158 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Elk4P41158 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Elk4P41158 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Elk4P41158 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Elk4P41158 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Elk4P41158 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Elk4P41158 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Elk4P41158 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.4 ms