Protein–RNA interactions for Protein: P35375

Ptger1, Prostaglandin E2 receptor EP1 subtype, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptger1P35375 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ptger1P35375 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ptger1P35375 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ptger1P35375 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ptger1P35375 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ptger1P35375 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ptger1P35375 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ptger1P35375 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ptger1P35375 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ptger1P35375 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ptger1P35375 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ptger1P35375 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ptger1P35375 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ptger1P35375 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ptger1P35375 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ptger1P35375 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ptger1P35375 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ptger1P35375 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ptger1P35375 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ptger1P35375 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ptger1P35375 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ptger1P35375 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ptger1P35375 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ptger1P35375 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ptger1P35375 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ptger1P35375 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ptger1P35375 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ptger1P35375 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ptger1P35375 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ptger1P35375 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ptger1P35375 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ptger1P35375 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ptger1P35375 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ptger1P35375 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ptger1P35375 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ptger1P35375 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ptger1P35375 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ptger1P35375 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ptger1P35375 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ptger1P35375 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ptger1P35375 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ptger1P35375 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ptger1P35375 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ptger1P35375 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ptger1P35375 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ptger1P35375 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ptger1P35375 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ptger1P35375 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ptger1P35375 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ptger1P35375 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ptger1P35375 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ptger1P35375 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ptger1P35375 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ptger1P35375 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ptger1P35375 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ptger1P35375 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ptger1P35375 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ptger1P35375 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ptger1P35375 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ptger1P35375 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ptger1P35375 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ptger1P35375 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ptger1P35375 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ptger1P35375 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ptger1P35375 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ptger1P35375 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ptger1P35375 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ptger1P35375 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ptger1P35375 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ptger1P35375 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ptger1P35375 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ptger1P35375 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ptger1P35375 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ptger1P35375 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ptger1P35375 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ptger1P35375 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ptger1P35375 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ptger1P35375 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ptger1P35375 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ptger1P35375 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ptger1P35375 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ptger1P35375 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ptger1P35375 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ptger1P35375 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ptger1P35375 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ptger1P35375 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ptger1P35375 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ptger1P35375 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ptger1P35375 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ptger1P35375 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ptger1P35375 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ptger1P35375 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ptger1P35375 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ptger1P35375 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ptger1P35375 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ptger1P35375 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ptger1P35375 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ptger1P35375 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ptger1P35375 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ptger1P35375 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms