Protein–RNA interactions for Protein: P28663

Napb, Beta-soluble NSF attachment protein, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapbP28663 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NapbP28663 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NapbP28663 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NapbP28663 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NapbP28663 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NapbP28663 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NapbP28663 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NapbP28663 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NapbP28663 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NapbP28663 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NapbP28663 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NapbP28663 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NapbP28663 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NapbP28663 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NapbP28663 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NapbP28663 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NapbP28663 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NapbP28663 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NapbP28663 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NapbP28663 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NapbP28663 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NapbP28663 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NapbP28663 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NapbP28663 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NapbP28663 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NapbP28663 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NapbP28663 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NapbP28663 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NapbP28663 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NapbP28663 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NapbP28663 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NapbP28663 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NapbP28663 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NapbP28663 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NapbP28663 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NapbP28663 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NapbP28663 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NapbP28663 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NapbP28663 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NapbP28663 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NapbP28663 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NapbP28663 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NapbP28663 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NapbP28663 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NapbP28663 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NapbP28663 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NapbP28663 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NapbP28663 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NapbP28663 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NapbP28663 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
NapbP28663 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NapbP28663 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NapbP28663 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NapbP28663 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NapbP28663 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NapbP28663 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NapbP28663 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NapbP28663 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NapbP28663 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NapbP28663 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NapbP28663 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NapbP28663 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NapbP28663 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NapbP28663 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NapbP28663 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NapbP28663 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NapbP28663 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NapbP28663 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NapbP28663 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NapbP28663 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NapbP28663 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
NapbP28663 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
NapbP28663 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NapbP28663 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NapbP28663 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NapbP28663 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NapbP28663 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NapbP28663 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NapbP28663 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
NapbP28663 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NapbP28663 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NapbP28663 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NapbP28663 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NapbP28663 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NapbP28663 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NapbP28663 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NapbP28663 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NapbP28663 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NapbP28663 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NapbP28663 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NapbP28663 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
NapbP28663 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NapbP28663 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NapbP28663 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NapbP28663 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NapbP28663 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
NapbP28663 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NapbP28663 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NapbP28663 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NapbP28663 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms