Protein–RNA interactions for Protein: P16092

Fgfr1, Fibroblast growth factor receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgfr1P16092 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fgfr1P16092 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fgfr1P16092 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fgfr1P16092 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fgfr1P16092 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fgfr1P16092 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fgfr1P16092 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fgfr1P16092 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fgfr1P16092 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Fgfr1P16092 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fgfr1P16092 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fgfr1P16092 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fgfr1P16092 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fgfr1P16092 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fgfr1P16092 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fgfr1P16092 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fgfr1P16092 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fgfr1P16092 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fgfr1P16092 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fgfr1P16092 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fgfr1P16092 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fgfr1P16092 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fgfr1P16092 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fgfr1P16092 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fgfr1P16092 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fgfr1P16092 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fgfr1P16092 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fgfr1P16092 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fgfr1P16092 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fgfr1P16092 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fgfr1P16092 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fgfr1P16092 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fgfr1P16092 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fgfr1P16092 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fgfr1P16092 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fgfr1P16092 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fgfr1P16092 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fgfr1P16092 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fgfr1P16092 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fgfr1P16092 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fgfr1P16092 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fgfr1P16092 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fgfr1P16092 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fgfr1P16092 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fgfr1P16092 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Fgfr1P16092 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fgfr1P16092 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fgfr1P16092 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Fgfr1P16092 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fgfr1P16092 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fgfr1P16092 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fgfr1P16092 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fgfr1P16092 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fgfr1P16092 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fgfr1P16092 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fgfr1P16092 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fgfr1P16092 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fgfr1P16092 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fgfr1P16092 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fgfr1P16092 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fgfr1P16092 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fgfr1P16092 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fgfr1P16092 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fgfr1P16092 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fgfr1P16092 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Fgfr1P16092 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fgfr1P16092 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fgfr1P16092 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fgfr1P16092 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fgfr1P16092 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Fgfr1P16092 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fgfr1P16092 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Fgfr1P16092 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Fgfr1P16092 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fgfr1P16092 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fgfr1P16092 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fgfr1P16092 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fgfr1P16092 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fgfr1P16092 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fgfr1P16092 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fgfr1P16092 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fgfr1P16092 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fgfr1P16092 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fgfr1P16092 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fgfr1P16092 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fgfr1P16092 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fgfr1P16092 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fgfr1P16092 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fgfr1P16092 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fgfr1P16092 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fgfr1P16092 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fgfr1P16092 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fgfr1P16092 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fgfr1P16092 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fgfr1P16092 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fgfr1P16092 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Fgfr1P16092 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fgfr1P16092 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fgfr1P16092 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fgfr1P16092 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.5 ms