Protein–RNA interactions for Protein: P01734

T-cell receptor beta chain V region 3H.25, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01734 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
P01734 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
P01734 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
P01734 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
P01734 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
P01734 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
P01734 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
P01734 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
P01734 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
P01734 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
P01734 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
P01734 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
P01734 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
P01734 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
P01734 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
P01734 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
P01734 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
P01734 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
P01734 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
P01734 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
P01734 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
P01734 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
P01734 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
P01734 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
P01734 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
P01734 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
P01734 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
P01734 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
P01734 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
P01734 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
P01734 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
P01734 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
P01734 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
P01734 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
P01734 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
P01734 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
P01734 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
P01734 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
P01734 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
P01734 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
P01734 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
P01734 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
P01734 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
P01734 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
P01734 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
P01734 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
P01734 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
P01734 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
P01734 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
P01734 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
P01734 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
P01734 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
P01734 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
P01734 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
P01734 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
P01734 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
P01734 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
P01734 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
P01734 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
P01734 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
P01734 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
P01734 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
P01734 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
P01734 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
P01734 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
P01734 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
P01734 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
P01734 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
P01734 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
P01734 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
P01734 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
P01734 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
P01734 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
P01734 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
P01734 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
P01734 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
P01734 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
P01734 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
P01734 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
P01734 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
P01734 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
P01734 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
P01734 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
P01734 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
P01734 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
P01734 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
P01734 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
P01734 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
P01734 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
P01734 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
P01734 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
P01734 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
P01734 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
P01734 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
P01734 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
P01734 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
P01734 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
P01734 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
P01734 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
P01734 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms