Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ6

Gm3336, Predicted gene 3336, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3336J3QMQ6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm3336J3QMQ6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm3336J3QMQ6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm3336J3QMQ6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm3336J3QMQ6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm3336J3QMQ6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm3336J3QMQ6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm3336J3QMQ6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm3336J3QMQ6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm3336J3QMQ6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gm3336J3QMQ6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gm3336J3QMQ6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm3336J3QMQ6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm3336J3QMQ6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm3336J3QMQ6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm3336J3QMQ6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm3336J3QMQ6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm3336J3QMQ6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm3336J3QMQ6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm3336J3QMQ6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm3336J3QMQ6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm3336J3QMQ6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm3336J3QMQ6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm3336J3QMQ6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm3336J3QMQ6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm3336J3QMQ6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm3336J3QMQ6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm3336J3QMQ6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm3336J3QMQ6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm3336J3QMQ6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm3336J3QMQ6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm3336J3QMQ6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm3336J3QMQ6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm3336J3QMQ6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm3336J3QMQ6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm3336J3QMQ6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm3336J3QMQ6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm3336J3QMQ6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm3336J3QMQ6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm3336J3QMQ6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm3336J3QMQ6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm3336J3QMQ6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm3336J3QMQ6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm3336J3QMQ6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm3336J3QMQ6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm3336J3QMQ6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm3336J3QMQ6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm3336J3QMQ6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm3336J3QMQ6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm3336J3QMQ6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm3336J3QMQ6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm3336J3QMQ6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm3336J3QMQ6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm3336J3QMQ6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm3336J3QMQ6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm3336J3QMQ6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm3336J3QMQ6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm3336J3QMQ6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm3336J3QMQ6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm3336J3QMQ6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm3336J3QMQ6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm3336J3QMQ6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm3336J3QMQ6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm3336J3QMQ6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm3336J3QMQ6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm3336J3QMQ6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm3336J3QMQ6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm3336J3QMQ6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm3336J3QMQ6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gm3336J3QMQ6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm3336J3QMQ6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm3336J3QMQ6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm3336J3QMQ6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm3336J3QMQ6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm3336J3QMQ6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm3336J3QMQ6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm3336J3QMQ6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm3336J3QMQ6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm3336J3QMQ6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm3336J3QMQ6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm3336J3QMQ6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm3336J3QMQ6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm3336J3QMQ6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm3336J3QMQ6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm3336J3QMQ6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm3336J3QMQ6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm3336J3QMQ6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm3336J3QMQ6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm3336J3QMQ6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gm3336J3QMQ6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm3336J3QMQ6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm3336J3QMQ6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm3336J3QMQ6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm3336J3QMQ6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm3336J3QMQ6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm3336J3QMQ6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm3336J3QMQ6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm3336J3QMQ6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm3336J3QMQ6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm3336J3QMQ6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.2 ms