Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ScaperF8VQ70 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ScaperF8VQ70 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ScaperF8VQ70 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ScaperF8VQ70 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ScaperF8VQ70 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ScaperF8VQ70 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ScaperF8VQ70 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ScaperF8VQ70 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ScaperF8VQ70 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ScaperF8VQ70 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ScaperF8VQ70 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ScaperF8VQ70 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
ScaperF8VQ70 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ScaperF8VQ70 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ScaperF8VQ70 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ScaperF8VQ70 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ScaperF8VQ70 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ScaperF8VQ70 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ScaperF8VQ70 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ScaperF8VQ70 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ScaperF8VQ70 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ScaperF8VQ70 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ScaperF8VQ70 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ScaperF8VQ70 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ScaperF8VQ70 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
ScaperF8VQ70 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
ScaperF8VQ70 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
ScaperF8VQ70 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ScaperF8VQ70 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ScaperF8VQ70 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ScaperF8VQ70 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ScaperF8VQ70 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ScaperF8VQ70 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ScaperF8VQ70 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ScaperF8VQ70 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ScaperF8VQ70 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ScaperF8VQ70 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ScaperF8VQ70 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ScaperF8VQ70 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ScaperF8VQ70 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ScaperF8VQ70 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ScaperF8VQ70 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ScaperF8VQ70 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ScaperF8VQ70 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ScaperF8VQ70 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ScaperF8VQ70 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ScaperF8VQ70 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ScaperF8VQ70 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ScaperF8VQ70 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ScaperF8VQ70 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
ScaperF8VQ70 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.24
ScaperF8VQ70 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.24
ScaperF8VQ70 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ScaperF8VQ70 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
ScaperF8VQ70 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ScaperF8VQ70 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
ScaperF8VQ70 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ScaperF8VQ70 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ScaperF8VQ70 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ScaperF8VQ70 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ScaperF8VQ70 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ScaperF8VQ70 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ScaperF8VQ70 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ScaperF8VQ70 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ScaperF8VQ70 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ScaperF8VQ70 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ScaperF8VQ70 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ScaperF8VQ70 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ScaperF8VQ70 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ScaperF8VQ70 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ScaperF8VQ70 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ScaperF8VQ70 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ScaperF8VQ70 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ScaperF8VQ70 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ScaperF8VQ70 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ScaperF8VQ70 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ScaperF8VQ70 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ScaperF8VQ70 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ScaperF8VQ70 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ScaperF8VQ70 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ScaperF8VQ70 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ScaperF8VQ70 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ScaperF8VQ70 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ScaperF8VQ70 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
ScaperF8VQ70 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ScaperF8VQ70 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ScaperF8VQ70 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
ScaperF8VQ70 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ScaperF8VQ70 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
ScaperF8VQ70 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ScaperF8VQ70 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ScaperF8VQ70 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
ScaperF8VQ70 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ScaperF8VQ70 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ScaperF8VQ70 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
ScaperF8VQ70 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
ScaperF8VQ70 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ScaperF8VQ70 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ScaperF8VQ70 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 353.6 ms