Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20538F6Z9R1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm20538F6Z9R1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm20538F6Z9R1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm20538F6Z9R1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm20538F6Z9R1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm20538F6Z9R1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20538F6Z9R1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20538F6Z9R1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20538F6Z9R1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20538F6Z9R1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20538F6Z9R1 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20538F6Z9R1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20538F6Z9R1 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20538F6Z9R1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20538F6Z9R1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20538F6Z9R1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20538F6Z9R1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20538F6Z9R1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20538F6Z9R1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20538F6Z9R1 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20538F6Z9R1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20538F6Z9R1 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20538F6Z9R1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20538F6Z9R1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20538F6Z9R1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20538F6Z9R1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20538F6Z9R1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20538F6Z9R1 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20538F6Z9R1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20538F6Z9R1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20538F6Z9R1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20538F6Z9R1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20538F6Z9R1 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20538F6Z9R1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20538F6Z9R1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20538F6Z9R1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20538F6Z9R1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20538F6Z9R1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20538F6Z9R1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20538F6Z9R1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20538F6Z9R1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20538F6Z9R1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20538F6Z9R1 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20538F6Z9R1 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20538F6Z9R1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20538F6Z9R1 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20538F6Z9R1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20538F6Z9R1 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20538F6Z9R1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20538F6Z9R1 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20538F6Z9R1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm20538F6Z9R1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm20538F6Z9R1 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm20538F6Z9R1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20538F6Z9R1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20538F6Z9R1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20538F6Z9R1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20538F6Z9R1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20538F6Z9R1 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20538F6Z9R1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20538F6Z9R1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20538F6Z9R1 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20538F6Z9R1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20538F6Z9R1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20538F6Z9R1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20538F6Z9R1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20538F6Z9R1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20538F6Z9R1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20538F6Z9R1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20538F6Z9R1 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20538F6Z9R1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20538F6Z9R1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20538F6Z9R1 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20538F6Z9R1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20538F6Z9R1 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20538F6Z9R1 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20538F6Z9R1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20538F6Z9R1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20538F6Z9R1 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20538F6Z9R1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20538F6Z9R1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20538F6Z9R1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20538F6Z9R1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20538F6Z9R1 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20538F6Z9R1 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20538F6Z9R1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20538F6Z9R1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20538F6Z9R1 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20538F6Z9R1 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20538F6Z9R1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20538F6Z9R1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20538F6Z9R1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20538F6Z9R1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20538F6Z9R1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20538F6Z9R1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20538F6Z9R1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20538F6Z9R1 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20538F6Z9R1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20538F6Z9R1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms