Protein–RNA interactions for Protein: E9Q328

5430401F13Rik, RIKEN cDNA 5430401F13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430401F13RikE9Q328 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
5430401F13RikE9Q328 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
5430401F13RikE9Q328 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
5430401F13RikE9Q328 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
5430401F13RikE9Q328 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
5430401F13RikE9Q328 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
5430401F13RikE9Q328 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
5430401F13RikE9Q328 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
5430401F13RikE9Q328 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
5430401F13RikE9Q328 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
5430401F13RikE9Q328 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
5430401F13RikE9Q328 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
5430401F13RikE9Q328 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.31■■□□□ 1
5430401F13RikE9Q328 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.31■■□□□ 1
5430401F13RikE9Q328 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
5430401F13RikE9Q328 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
5430401F13RikE9Q328 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
5430401F13RikE9Q328 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
5430401F13RikE9Q328 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
5430401F13RikE9Q328 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
5430401F13RikE9Q328 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
5430401F13RikE9Q328 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
5430401F13RikE9Q328 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
5430401F13RikE9Q328 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
5430401F13RikE9Q328 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
5430401F13RikE9Q328 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
5430401F13RikE9Q328 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
5430401F13RikE9Q328 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
5430401F13RikE9Q328 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
5430401F13RikE9Q328 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
5430401F13RikE9Q328 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
5430401F13RikE9Q328 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
5430401F13RikE9Q328 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
5430401F13RikE9Q328 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.27■■□□□ 1
5430401F13RikE9Q328 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.27■■□□□ 1
5430401F13RikE9Q328 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
5430401F13RikE9Q328 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
5430401F13RikE9Q328 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
5430401F13RikE9Q328 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
5430401F13RikE9Q328 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
5430401F13RikE9Q328 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
5430401F13RikE9Q328 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
5430401F13RikE9Q328 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
5430401F13RikE9Q328 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
5430401F13RikE9Q328 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
5430401F13RikE9Q328 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
5430401F13RikE9Q328 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
5430401F13RikE9Q328 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
5430401F13RikE9Q328 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
5430401F13RikE9Q328 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
5430401F13RikE9Q328 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
5430401F13RikE9Q328 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
5430401F13RikE9Q328 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
5430401F13RikE9Q328 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
5430401F13RikE9Q328 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
5430401F13RikE9Q328 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
5430401F13RikE9Q328 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
5430401F13RikE9Q328 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
5430401F13RikE9Q328 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
5430401F13RikE9Q328 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
5430401F13RikE9Q328 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
5430401F13RikE9Q328 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
5430401F13RikE9Q328 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
5430401F13RikE9Q328 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
5430401F13RikE9Q328 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
5430401F13RikE9Q328 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
5430401F13RikE9Q328 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
5430401F13RikE9Q328 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
5430401F13RikE9Q328 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
5430401F13RikE9Q328 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
5430401F13RikE9Q328 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
5430401F13RikE9Q328 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
5430401F13RikE9Q328 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
5430401F13RikE9Q328 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
5430401F13RikE9Q328 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
5430401F13RikE9Q328 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
5430401F13RikE9Q328 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
5430401F13RikE9Q328 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
5430401F13RikE9Q328 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
5430401F13RikE9Q328 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
5430401F13RikE9Q328 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
5430401F13RikE9Q328 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
5430401F13RikE9Q328 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
5430401F13RikE9Q328 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
5430401F13RikE9Q328 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
5430401F13RikE9Q328 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
5430401F13RikE9Q328 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
5430401F13RikE9Q328 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
5430401F13RikE9Q328 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
5430401F13RikE9Q328 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
5430401F13RikE9Q328 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
5430401F13RikE9Q328 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
5430401F13RikE9Q328 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
5430401F13RikE9Q328 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
5430401F13RikE9Q328 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
5430401F13RikE9Q328 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
5430401F13RikE9Q328 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
5430401F13RikE9Q328 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
5430401F13RikE9Q328 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
5430401F13RikE9Q328 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms