Protein–RNA interactions for Protein: D6MZJ6

Smpd5, MCG22096, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd5D6MZJ6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smpd5D6MZJ6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smpd5D6MZJ6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smpd5D6MZJ6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smpd5D6MZJ6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smpd5D6MZJ6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smpd5D6MZJ6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smpd5D6MZJ6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smpd5D6MZJ6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smpd5D6MZJ6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smpd5D6MZJ6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smpd5D6MZJ6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smpd5D6MZJ6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smpd5D6MZJ6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smpd5D6MZJ6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smpd5D6MZJ6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Smpd5D6MZJ6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smpd5D6MZJ6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smpd5D6MZJ6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smpd5D6MZJ6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smpd5D6MZJ6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smpd5D6MZJ6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smpd5D6MZJ6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smpd5D6MZJ6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smpd5D6MZJ6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smpd5D6MZJ6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smpd5D6MZJ6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Smpd5D6MZJ6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Smpd5D6MZJ6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smpd5D6MZJ6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smpd5D6MZJ6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smpd5D6MZJ6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smpd5D6MZJ6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smpd5D6MZJ6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smpd5D6MZJ6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smpd5D6MZJ6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Smpd5D6MZJ6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smpd5D6MZJ6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smpd5D6MZJ6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smpd5D6MZJ6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smpd5D6MZJ6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smpd5D6MZJ6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smpd5D6MZJ6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Smpd5D6MZJ6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smpd5D6MZJ6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smpd5D6MZJ6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Smpd5D6MZJ6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smpd5D6MZJ6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smpd5D6MZJ6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Smpd5D6MZJ6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smpd5D6MZJ6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Smpd5D6MZJ6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smpd5D6MZJ6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smpd5D6MZJ6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Smpd5D6MZJ6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smpd5D6MZJ6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smpd5D6MZJ6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Smpd5D6MZJ6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smpd5D6MZJ6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Smpd5D6MZJ6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smpd5D6MZJ6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smpd5D6MZJ6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smpd5D6MZJ6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Smpd5D6MZJ6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smpd5D6MZJ6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smpd5D6MZJ6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smpd5D6MZJ6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smpd5D6MZJ6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smpd5D6MZJ6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Smpd5D6MZJ6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smpd5D6MZJ6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Smpd5D6MZJ6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smpd5D6MZJ6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smpd5D6MZJ6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Smpd5D6MZJ6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smpd5D6MZJ6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Smpd5D6MZJ6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smpd5D6MZJ6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Smpd5D6MZJ6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Smpd5D6MZJ6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Smpd5D6MZJ6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smpd5D6MZJ6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smpd5D6MZJ6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smpd5D6MZJ6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smpd5D6MZJ6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smpd5D6MZJ6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smpd5D6MZJ6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smpd5D6MZJ6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Smpd5D6MZJ6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smpd5D6MZJ6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smpd5D6MZJ6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smpd5D6MZJ6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smpd5D6MZJ6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smpd5D6MZJ6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smpd5D6MZJ6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smpd5D6MZJ6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smpd5D6MZJ6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smpd5D6MZJ6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smpd5D6MZJ6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smpd5D6MZJ6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 551.3 ms