Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PtprfA2A8L5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PtprfA2A8L5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PtprfA2A8L5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PtprfA2A8L5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PtprfA2A8L5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PtprfA2A8L5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PtprfA2A8L5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PtprfA2A8L5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PtprfA2A8L5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PtprfA2A8L5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PtprfA2A8L5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PtprfA2A8L5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PtprfA2A8L5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PtprfA2A8L5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PtprfA2A8L5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PtprfA2A8L5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PtprfA2A8L5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PtprfA2A8L5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PtprfA2A8L5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PtprfA2A8L5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PtprfA2A8L5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PtprfA2A8L5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PtprfA2A8L5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PtprfA2A8L5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PtprfA2A8L5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PtprfA2A8L5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PtprfA2A8L5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PtprfA2A8L5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PtprfA2A8L5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PtprfA2A8L5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PtprfA2A8L5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PtprfA2A8L5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PtprfA2A8L5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PtprfA2A8L5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PtprfA2A8L5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PtprfA2A8L5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PtprfA2A8L5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PtprfA2A8L5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PtprfA2A8L5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PtprfA2A8L5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtprfA2A8L5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtprfA2A8L5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtprfA2A8L5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtprfA2A8L5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PtprfA2A8L5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PtprfA2A8L5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PtprfA2A8L5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PtprfA2A8L5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PtprfA2A8L5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PtprfA2A8L5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PtprfA2A8L5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PtprfA2A8L5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PtprfA2A8L5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PtprfA2A8L5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PtprfA2A8L5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PtprfA2A8L5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PtprfA2A8L5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PtprfA2A8L5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PtprfA2A8L5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PtprfA2A8L5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PtprfA2A8L5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PtprfA2A8L5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprfA2A8L5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprfA2A8L5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprfA2A8L5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprfA2A8L5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtprfA2A8L5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtprfA2A8L5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PtprfA2A8L5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PtprfA2A8L5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PtprfA2A8L5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PtprfA2A8L5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PtprfA2A8L5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PtprfA2A8L5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PtprfA2A8L5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PtprfA2A8L5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PtprfA2A8L5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtprfA2A8L5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtprfA2A8L5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtprfA2A8L5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtprfA2A8L5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtprfA2A8L5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtprfA2A8L5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtprfA2A8L5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PtprfA2A8L5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PtprfA2A8L5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PtprfA2A8L5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PtprfA2A8L5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PtprfA2A8L5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PtprfA2A8L5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PtprfA2A8L5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PtprfA2A8L5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PtprfA2A8L5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PtprfA2A8L5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PtprfA2A8L5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PtprfA2A8L5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PtprfA2A8L5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PtprfA2A8L5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PtprfA2A8L5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms