Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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