Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Speer3W4VSP1 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms