Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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