Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z306

Slc22a4, Solute carrier family 22 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a4Q9Z306 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc22a4Q9Z306 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc22a4Q9Z306 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc22a4Q9Z306 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc22a4Q9Z306 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc22a4Q9Z306 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc22a4Q9Z306 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc22a4Q9Z306 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc22a4Q9Z306 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc22a4Q9Z306 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc22a4Q9Z306 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc22a4Q9Z306 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc22a4Q9Z306 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc22a4Q9Z306 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc22a4Q9Z306 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc22a4Q9Z306 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc22a4Q9Z306 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc22a4Q9Z306 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc22a4Q9Z306 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc22a4Q9Z306 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc22a4Q9Z306 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc22a4Q9Z306 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc22a4Q9Z306 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc22a4Q9Z306 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc22a4Q9Z306 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc22a4Q9Z306 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc22a4Q9Z306 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc22a4Q9Z306 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc22a4Q9Z306 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc22a4Q9Z306 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc22a4Q9Z306 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc22a4Q9Z306 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc22a4Q9Z306 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc22a4Q9Z306 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc22a4Q9Z306 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc22a4Q9Z306 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc22a4Q9Z306 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc22a4Q9Z306 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc22a4Q9Z306 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc22a4Q9Z306 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc22a4Q9Z306 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc22a4Q9Z306 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc22a4Q9Z306 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc22a4Q9Z306 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc22a4Q9Z306 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc22a4Q9Z306 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc22a4Q9Z306 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc22a4Q9Z306 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc22a4Q9Z306 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc22a4Q9Z306 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc22a4Q9Z306 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc22a4Q9Z306 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc22a4Q9Z306 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc22a4Q9Z306 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc22a4Q9Z306 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc22a4Q9Z306 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc22a4Q9Z306 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc22a4Q9Z306 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc22a4Q9Z306 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc22a4Q9Z306 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc22a4Q9Z306 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc22a4Q9Z306 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc22a4Q9Z306 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc22a4Q9Z306 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc22a4Q9Z306 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc22a4Q9Z306 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc22a4Q9Z306 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc22a4Q9Z306 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc22a4Q9Z306 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc22a4Q9Z306 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc22a4Q9Z306 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc22a4Q9Z306 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc22a4Q9Z306 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc22a4Q9Z306 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc22a4Q9Z306 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc22a4Q9Z306 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc22a4Q9Z306 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc22a4Q9Z306 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc22a4Q9Z306 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc22a4Q9Z306 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc22a4Q9Z306 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc22a4Q9Z306 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc22a4Q9Z306 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc22a4Q9Z306 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc22a4Q9Z306 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc22a4Q9Z306 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc22a4Q9Z306 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc22a4Q9Z306 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc22a4Q9Z306 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc22a4Q9Z306 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc22a4Q9Z306 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc22a4Q9Z306 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc22a4Q9Z306 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc22a4Q9Z306 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc22a4Q9Z306 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc22a4Q9Z306 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc22a4Q9Z306 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc22a4Q9Z306 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc22a4Q9Z306 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc22a4Q9Z306 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms