Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hdac5Q9Z2V6 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
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