Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q5

Mrpl40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl40Q9Z2Q5 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms