Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vamp5Q9Z2P8 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vamp5Q9Z2P8 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vamp5Q9Z2P8 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vamp5Q9Z2P8 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vamp5Q9Z2P8 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vamp5Q9Z2P8 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vamp5Q9Z2P8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vamp5Q9Z2P8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vamp5Q9Z2P8 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vamp5Q9Z2P8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vamp5Q9Z2P8 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Vamp5Q9Z2P8 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Vamp5Q9Z2P8 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Vamp5Q9Z2P8 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vamp5Q9Z2P8 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vamp5Q9Z2P8 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vamp5Q9Z2P8 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vamp5Q9Z2P8 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vamp5Q9Z2P8 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Vamp5Q9Z2P8 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vamp5Q9Z2P8 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vamp5Q9Z2P8 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vamp5Q9Z2P8 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vamp5Q9Z2P8 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vamp5Q9Z2P8 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vamp5Q9Z2P8 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vamp5Q9Z2P8 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vamp5Q9Z2P8 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vamp5Q9Z2P8 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vamp5Q9Z2P8 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vamp5Q9Z2P8 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vamp5Q9Z2P8 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vamp5Q9Z2P8 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vamp5Q9Z2P8 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vamp5Q9Z2P8 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vamp5Q9Z2P8 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Vamp5Q9Z2P8 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vamp5Q9Z2P8 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vamp5Q9Z2P8 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vamp5Q9Z2P8 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vamp5Q9Z2P8 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vamp5Q9Z2P8 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vamp5Q9Z2P8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vamp5Q9Z2P8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vamp5Q9Z2P8 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vamp5Q9Z2P8 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vamp5Q9Z2P8 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vamp5Q9Z2P8 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vamp5Q9Z2P8 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vamp5Q9Z2P8 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vamp5Q9Z2P8 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vamp5Q9Z2P8 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vamp5Q9Z2P8 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vamp5Q9Z2P8 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vamp5Q9Z2P8 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vamp5Q9Z2P8 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vamp5Q9Z2P8 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vamp5Q9Z2P8 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vamp5Q9Z2P8 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vamp5Q9Z2P8 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Vamp5Q9Z2P8 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vamp5Q9Z2P8 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vamp5Q9Z2P8 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vamp5Q9Z2P8 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vamp5Q9Z2P8 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vamp5Q9Z2P8 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vamp5Q9Z2P8 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vamp5Q9Z2P8 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vamp5Q9Z2P8 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Vamp5Q9Z2P8 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vamp5Q9Z2P8 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vamp5Q9Z2P8 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vamp5Q9Z2P8 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vamp5Q9Z2P8 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Vamp5Q9Z2P8 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vamp5Q9Z2P8 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Vamp5Q9Z2P8 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Vamp5Q9Z2P8 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Vamp5Q9Z2P8 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Vamp5Q9Z2P8 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Vamp5Q9Z2P8 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Vamp5Q9Z2P8 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Vamp5Q9Z2P8 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Vamp5Q9Z2P8 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Vamp5Q9Z2P8 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Vamp5Q9Z2P8 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Vamp5Q9Z2P8 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Vamp5Q9Z2P8 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Vamp5Q9Z2P8 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Vamp5Q9Z2P8 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Vamp5Q9Z2P8 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Vamp5Q9Z2P8 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Vamp5Q9Z2P8 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Vamp5Q9Z2P8 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Vamp5Q9Z2P8 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Vamp5Q9Z2P8 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Vamp5Q9Z2P8 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Vamp5Q9Z2P8 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Vamp5Q9Z2P8 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms