Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Ubl3Q9Z2M6 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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