Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
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Crlf3Q9Z2L7 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Crlf3Q9Z2L7 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Crlf3Q9Z2L7 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Crlf3Q9Z2L7 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Crlf3Q9Z2L7 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Crlf3Q9Z2L7 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Crlf3Q9Z2L7 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Crlf3Q9Z2L7 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
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Crlf3Q9Z2L7 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Crlf3Q9Z2L7 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms