Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Pdpk1Q9Z2A0 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdpk1Q9Z2A0 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdpk1Q9Z2A0 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdpk1Q9Z2A0 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdpk1Q9Z2A0 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdpk1Q9Z2A0 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdpk1Q9Z2A0 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Pdpk1Q9Z2A0 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdpk1Q9Z2A0 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdpk1Q9Z2A0 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdpk1Q9Z2A0 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Pdpk1Q9Z2A0 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdpk1Q9Z2A0 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdpk1Q9Z2A0 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdpk1Q9Z2A0 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdpk1Q9Z2A0 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdpk1Q9Z2A0 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdpk1Q9Z2A0 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Pdpk1Q9Z2A0 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdpk1Q9Z2A0 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Pdpk1Q9Z2A0 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Pdpk1Q9Z2A0 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Pdpk1Q9Z2A0 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Pdpk1Q9Z2A0 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdpk1Q9Z2A0 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdpk1Q9Z2A0 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdpk1Q9Z2A0 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdpk1Q9Z2A0 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdpk1Q9Z2A0 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdpk1Q9Z2A0 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdpk1Q9Z2A0 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdpk1Q9Z2A0 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdpk1Q9Z2A0 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdpk1Q9Z2A0 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdpk1Q9Z2A0 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdpk1Q9Z2A0 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdpk1Q9Z2A0 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdpk1Q9Z2A0 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdpk1Q9Z2A0 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdpk1Q9Z2A0 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdpk1Q9Z2A0 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdpk1Q9Z2A0 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdpk1Q9Z2A0 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdpk1Q9Z2A0 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdpk1Q9Z2A0 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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