Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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