Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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