Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z238

Ccne2, G1/S-specific cyclin-E2, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne2Q9Z238 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccne2Q9Z238 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccne2Q9Z238 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccne2Q9Z238 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccne2Q9Z238 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccne2Q9Z238 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccne2Q9Z238 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccne2Q9Z238 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccne2Q9Z238 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccne2Q9Z238 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccne2Q9Z238 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccne2Q9Z238 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccne2Q9Z238 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccne2Q9Z238 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccne2Q9Z238 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccne2Q9Z238 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccne2Q9Z238 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccne2Q9Z238 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccne2Q9Z238 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccne2Q9Z238 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccne2Q9Z238 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccne2Q9Z238 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccne2Q9Z238 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccne2Q9Z238 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccne2Q9Z238 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccne2Q9Z238 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccne2Q9Z238 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccne2Q9Z238 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccne2Q9Z238 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccne2Q9Z238 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccne2Q9Z238 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccne2Q9Z238 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccne2Q9Z238 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccne2Q9Z238 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccne2Q9Z238 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccne2Q9Z238 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccne2Q9Z238 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccne2Q9Z238 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccne2Q9Z238 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccne2Q9Z238 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccne2Q9Z238 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccne2Q9Z238 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccne2Q9Z238 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms