Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

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Length 907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms