Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z179

Shcbp1, SHC SH2 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1Q9Z179 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shcbp1Q9Z179 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms