Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne6Q9Z140 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms