Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W3

Nup160, Nuclear pore complex protein Nup160, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup160Q9Z0W3 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nup160Q9Z0W3 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nup160Q9Z0W3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nup160Q9Z0W3 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nup160Q9Z0W3 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nup160Q9Z0W3 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nup160Q9Z0W3 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nup160Q9Z0W3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nup160Q9Z0W3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nup160Q9Z0W3 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nup160Q9Z0W3 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nup160Q9Z0W3 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nup160Q9Z0W3 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nup160Q9Z0W3 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nup160Q9Z0W3 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nup160Q9Z0W3 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nup160Q9Z0W3 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nup160Q9Z0W3 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Nup160Q9Z0W3 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nup160Q9Z0W3 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nup160Q9Z0W3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nup160Q9Z0W3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nup160Q9Z0W3 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Nup160Q9Z0W3 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nup160Q9Z0W3 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nup160Q9Z0W3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nup160Q9Z0W3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nup160Q9Z0W3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nup160Q9Z0W3 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Nup160Q9Z0W3 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nup160Q9Z0W3 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nup160Q9Z0W3 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nup160Q9Z0W3 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Nup160Q9Z0W3 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Nup160Q9Z0W3 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Nup160Q9Z0W3 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Nup160Q9Z0W3 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Nup160Q9Z0W3 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Nup160Q9Z0W3 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Nup160Q9Z0W3 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Nup160Q9Z0W3 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Nup160Q9Z0W3 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Nup160Q9Z0W3 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Nup160Q9Z0W3 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Nup160Q9Z0W3 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Nup160Q9Z0W3 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Nup160Q9Z0W3 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Nup160Q9Z0W3 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Nup160Q9Z0W3 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Nup160Q9Z0W3 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Nup160Q9Z0W3 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Nup160Q9Z0W3 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Nup160Q9Z0W3 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Nup160Q9Z0W3 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Nup160Q9Z0W3 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Nup160Q9Z0W3 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nup160Q9Z0W3 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nup160Q9Z0W3 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nup160Q9Z0W3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nup160Q9Z0W3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nup160Q9Z0W3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nup160Q9Z0W3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nup160Q9Z0W3 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nup160Q9Z0W3 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nup160Q9Z0W3 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nup160Q9Z0W3 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nup160Q9Z0W3 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Nup160Q9Z0W3 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nup160Q9Z0W3 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nup160Q9Z0W3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nup160Q9Z0W3 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Nup160Q9Z0W3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nup160Q9Z0W3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nup160Q9Z0W3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Nup160Q9Z0W3 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Nup160Q9Z0W3 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nup160Q9Z0W3 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nup160Q9Z0W3 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nup160Q9Z0W3 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nup160Q9Z0W3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nup160Q9Z0W3 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nup160Q9Z0W3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nup160Q9Z0W3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nup160Q9Z0W3 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nup160Q9Z0W3 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nup160Q9Z0W3 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nup160Q9Z0W3 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nup160Q9Z0W3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nup160Q9Z0W3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nup160Q9Z0W3 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nup160Q9Z0W3 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nup160Q9Z0W3 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Nup160Q9Z0W3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nup160Q9Z0W3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nup160Q9Z0W3 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Nup160Q9Z0W3 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nup160Q9Z0W3 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Nup160Q9Z0W3 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Nup160Q9Z0W3 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nup160Q9Z0W3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms