Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms