Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0I7

Slfn1, Schlafen 1, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn1Q9Z0I7 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slfn1Q9Z0I7 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slfn1Q9Z0I7 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slfn1Q9Z0I7 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slfn1Q9Z0I7 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Slfn1Q9Z0I7 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slfn1Q9Z0I7 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slfn1Q9Z0I7 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slfn1Q9Z0I7 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slfn1Q9Z0I7 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slfn1Q9Z0I7 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slfn1Q9Z0I7 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slfn1Q9Z0I7 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slfn1Q9Z0I7 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slfn1Q9Z0I7 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Slfn1Q9Z0I7 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slfn1Q9Z0I7 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slfn1Q9Z0I7 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slfn1Q9Z0I7 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slfn1Q9Z0I7 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slfn1Q9Z0I7 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slfn1Q9Z0I7 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slfn1Q9Z0I7 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slfn1Q9Z0I7 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slfn1Q9Z0I7 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slfn1Q9Z0I7 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slfn1Q9Z0I7 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slfn1Q9Z0I7 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slfn1Q9Z0I7 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slfn1Q9Z0I7 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slfn1Q9Z0I7 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slfn1Q9Z0I7 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Slfn1Q9Z0I7 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slfn1Q9Z0I7 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Slfn1Q9Z0I7 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slfn1Q9Z0I7 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slfn1Q9Z0I7 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slfn1Q9Z0I7 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slfn1Q9Z0I7 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slfn1Q9Z0I7 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slfn1Q9Z0I7 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slfn1Q9Z0I7 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slfn1Q9Z0I7 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slfn1Q9Z0I7 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slfn1Q9Z0I7 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slfn1Q9Z0I7 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slfn1Q9Z0I7 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Slfn1Q9Z0I7 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Slfn1Q9Z0I7 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Slfn1Q9Z0I7 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slfn1Q9Z0I7 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slfn1Q9Z0I7 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slfn1Q9Z0I7 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slfn1Q9Z0I7 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slfn1Q9Z0I7 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slfn1Q9Z0I7 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slfn1Q9Z0I7 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slfn1Q9Z0I7 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slfn1Q9Z0I7 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slfn1Q9Z0I7 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Slfn1Q9Z0I7 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slfn1Q9Z0I7 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Slfn1Q9Z0I7 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slfn1Q9Z0I7 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slfn1Q9Z0I7 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slfn1Q9Z0I7 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slfn1Q9Z0I7 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slfn1Q9Z0I7 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slfn1Q9Z0I7 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slfn1Q9Z0I7 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slfn1Q9Z0I7 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Slfn1Q9Z0I7 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slfn1Q9Z0I7 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slfn1Q9Z0I7 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slfn1Q9Z0I7 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slfn1Q9Z0I7 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slfn1Q9Z0I7 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slfn1Q9Z0I7 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slfn1Q9Z0I7 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slfn1Q9Z0I7 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Slfn1Q9Z0I7 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Slfn1Q9Z0I7 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slfn1Q9Z0I7 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slfn1Q9Z0I7 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slfn1Q9Z0I7 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slfn1Q9Z0I7 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slfn1Q9Z0I7 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slfn1Q9Z0I7 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slfn1Q9Z0I7 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slfn1Q9Z0I7 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slfn1Q9Z0I7 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slfn1Q9Z0I7 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slfn1Q9Z0I7 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slfn1Q9Z0I7 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slfn1Q9Z0I7 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slfn1Q9Z0I7 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slfn1Q9Z0I7 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slfn1Q9Z0I7 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slfn1Q9Z0I7 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slfn1Q9Z0I7 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms