Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVP6

Papolb, Poly(A) polymerase beta, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PapolbQ9WVP6 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms