Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUK7

Opn3, Opsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn3Q9WUK7 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Opn3Q9WUK7 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Opn3Q9WUK7 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Opn3Q9WUK7 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Opn3Q9WUK7 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Opn3Q9WUK7 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Opn3Q9WUK7 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Opn3Q9WUK7 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Opn3Q9WUK7 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Opn3Q9WUK7 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Opn3Q9WUK7 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Opn3Q9WUK7 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Opn3Q9WUK7 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Opn3Q9WUK7 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Opn3Q9WUK7 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Opn3Q9WUK7 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Opn3Q9WUK7 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Opn3Q9WUK7 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Opn3Q9WUK7 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Opn3Q9WUK7 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Opn3Q9WUK7 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Opn3Q9WUK7 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Opn3Q9WUK7 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Opn3Q9WUK7 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Opn3Q9WUK7 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Opn3Q9WUK7 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Opn3Q9WUK7 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Opn3Q9WUK7 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Opn3Q9WUK7 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Opn3Q9WUK7 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Opn3Q9WUK7 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Opn3Q9WUK7 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Opn3Q9WUK7 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Opn3Q9WUK7 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Opn3Q9WUK7 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Opn3Q9WUK7 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Opn3Q9WUK7 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Opn3Q9WUK7 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Opn3Q9WUK7 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Opn3Q9WUK7 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Opn3Q9WUK7 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Opn3Q9WUK7 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Opn3Q9WUK7 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Opn3Q9WUK7 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Opn3Q9WUK7 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Opn3Q9WUK7 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Opn3Q9WUK7 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Opn3Q9WUK7 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Opn3Q9WUK7 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Opn3Q9WUK7 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Opn3Q9WUK7 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Opn3Q9WUK7 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Opn3Q9WUK7 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Opn3Q9WUK7 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Opn3Q9WUK7 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Opn3Q9WUK7 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Opn3Q9WUK7 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Opn3Q9WUK7 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Opn3Q9WUK7 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Opn3Q9WUK7 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Opn3Q9WUK7 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Opn3Q9WUK7 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Opn3Q9WUK7 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Opn3Q9WUK7 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Opn3Q9WUK7 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Opn3Q9WUK7 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Opn3Q9WUK7 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Opn3Q9WUK7 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Opn3Q9WUK7 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Opn3Q9WUK7 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Opn3Q9WUK7 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Opn3Q9WUK7 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Opn3Q9WUK7 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Opn3Q9WUK7 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Opn3Q9WUK7 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Opn3Q9WUK7 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Opn3Q9WUK7 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Opn3Q9WUK7 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Opn3Q9WUK7 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Opn3Q9WUK7 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Opn3Q9WUK7 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Opn3Q9WUK7 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Opn3Q9WUK7 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Opn3Q9WUK7 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Opn3Q9WUK7 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Opn3Q9WUK7 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Opn3Q9WUK7 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Opn3Q9WUK7 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Opn3Q9WUK7 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Opn3Q9WUK7 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Opn3Q9WUK7 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Opn3Q9WUK7 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Opn3Q9WUK7 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Opn3Q9WUK7 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Opn3Q9WUK7 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Opn3Q9WUK7 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Opn3Q9WUK7 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Opn3Q9WUK7 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Opn3Q9WUK7 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Opn3Q9WUK7 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms