Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUA2

Farsb, Phenylalanine--tRNA ligase beta subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsbQ9WUA2 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FarsbQ9WUA2 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FarsbQ9WUA2 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FarsbQ9WUA2 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FarsbQ9WUA2 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FarsbQ9WUA2 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FarsbQ9WUA2 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FarsbQ9WUA2 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FarsbQ9WUA2 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FarsbQ9WUA2 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FarsbQ9WUA2 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FarsbQ9WUA2 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FarsbQ9WUA2 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FarsbQ9WUA2 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FarsbQ9WUA2 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FarsbQ9WUA2 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FarsbQ9WUA2 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FarsbQ9WUA2 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FarsbQ9WUA2 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FarsbQ9WUA2 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FarsbQ9WUA2 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FarsbQ9WUA2 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FarsbQ9WUA2 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FarsbQ9WUA2 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FarsbQ9WUA2 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FarsbQ9WUA2 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FarsbQ9WUA2 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FarsbQ9WUA2 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FarsbQ9WUA2 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FarsbQ9WUA2 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FarsbQ9WUA2 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FarsbQ9WUA2 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FarsbQ9WUA2 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FarsbQ9WUA2 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FarsbQ9WUA2 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FarsbQ9WUA2 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FarsbQ9WUA2 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FarsbQ9WUA2 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FarsbQ9WUA2 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FarsbQ9WUA2 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FarsbQ9WUA2 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FarsbQ9WUA2 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FarsbQ9WUA2 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FarsbQ9WUA2 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FarsbQ9WUA2 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FarsbQ9WUA2 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FarsbQ9WUA2 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
FarsbQ9WUA2 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FarsbQ9WUA2 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FarsbQ9WUA2 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FarsbQ9WUA2 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FarsbQ9WUA2 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FarsbQ9WUA2 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FarsbQ9WUA2 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FarsbQ9WUA2 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FarsbQ9WUA2 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FarsbQ9WUA2 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FarsbQ9WUA2 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FarsbQ9WUA2 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FarsbQ9WUA2 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FarsbQ9WUA2 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FarsbQ9WUA2 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FarsbQ9WUA2 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FarsbQ9WUA2 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FarsbQ9WUA2 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FarsbQ9WUA2 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FarsbQ9WUA2 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FarsbQ9WUA2 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FarsbQ9WUA2 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FarsbQ9WUA2 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
FarsbQ9WUA2 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FarsbQ9WUA2 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FarsbQ9WUA2 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
FarsbQ9WUA2 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FarsbQ9WUA2 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FarsbQ9WUA2 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FarsbQ9WUA2 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FarsbQ9WUA2 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FarsbQ9WUA2 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FarsbQ9WUA2 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
FarsbQ9WUA2 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FarsbQ9WUA2 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FarsbQ9WUA2 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FarsbQ9WUA2 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FarsbQ9WUA2 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FarsbQ9WUA2 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FarsbQ9WUA2 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FarsbQ9WUA2 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FarsbQ9WUA2 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FarsbQ9WUA2 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FarsbQ9WUA2 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FarsbQ9WUA2 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FarsbQ9WUA2 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FarsbQ9WUA2 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FarsbQ9WUA2 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FarsbQ9WUA2 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FarsbQ9WUA2 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FarsbQ9WUA2 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FarsbQ9WUA2 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FarsbQ9WUA2 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms