Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU22

Ptpn4, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn4Q9WU22 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms