Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTP5

Cdh22, Cadherin-22, mousemouse

Predictions only

Length 813 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh22Q9WTP5 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdh22Q9WTP5 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdh22Q9WTP5 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdh22Q9WTP5 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdh22Q9WTP5 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdh22Q9WTP5 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdh22Q9WTP5 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdh22Q9WTP5 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdh22Q9WTP5 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdh22Q9WTP5 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdh22Q9WTP5 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdh22Q9WTP5 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdh22Q9WTP5 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdh22Q9WTP5 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdh22Q9WTP5 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdh22Q9WTP5 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdh22Q9WTP5 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdh22Q9WTP5 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdh22Q9WTP5 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdh22Q9WTP5 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdh22Q9WTP5 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdh22Q9WTP5 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdh22Q9WTP5 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdh22Q9WTP5 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdh22Q9WTP5 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdh22Q9WTP5 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdh22Q9WTP5 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdh22Q9WTP5 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdh22Q9WTP5 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdh22Q9WTP5 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdh22Q9WTP5 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdh22Q9WTP5 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdh22Q9WTP5 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdh22Q9WTP5 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdh22Q9WTP5 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdh22Q9WTP5 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdh22Q9WTP5 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdh22Q9WTP5 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdh22Q9WTP5 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdh22Q9WTP5 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdh22Q9WTP5 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdh22Q9WTP5 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdh22Q9WTP5 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdh22Q9WTP5 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdh22Q9WTP5 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdh22Q9WTP5 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdh22Q9WTP5 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdh22Q9WTP5 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdh22Q9WTP5 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdh22Q9WTP5 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdh22Q9WTP5 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdh22Q9WTP5 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdh22Q9WTP5 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdh22Q9WTP5 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdh22Q9WTP5 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdh22Q9WTP5 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdh22Q9WTP5 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdh22Q9WTP5 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdh22Q9WTP5 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdh22Q9WTP5 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdh22Q9WTP5 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdh22Q9WTP5 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdh22Q9WTP5 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdh22Q9WTP5 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdh22Q9WTP5 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdh22Q9WTP5 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdh22Q9WTP5 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdh22Q9WTP5 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdh22Q9WTP5 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdh22Q9WTP5 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh22Q9WTP5 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh22Q9WTP5 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh22Q9WTP5 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh22Q9WTP5 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh22Q9WTP5 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh22Q9WTP5 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh22Q9WTP5 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh22Q9WTP5 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh22Q9WTP5 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh22Q9WTP5 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh22Q9WTP5 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh22Q9WTP5 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh22Q9WTP5 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh22Q9WTP5 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh22Q9WTP5 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh22Q9WTP5 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh22Q9WTP5 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh22Q9WTP5 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh22Q9WTP5 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh22Q9WTP5 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh22Q9WTP5 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh22Q9WTP5 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh22Q9WTP5 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh22Q9WTP5 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh22Q9WTP5 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh22Q9WTP5 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh22Q9WTP5 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh22Q9WTP5 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh22Q9WTP5 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh22Q9WTP5 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms