Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1T4

Sept6, Septin-6, mousemouse

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept6Q9R1T4 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms