Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A9

Trex2, Three prime repair exonuclease 2, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trex2Q9R1A9 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms