Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Plod1Q9R0E2 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Plod1Q9R0E2 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms