Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Rnf4Q9QZS2 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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