Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD5

Chml, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmlQ9QZD5 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChmlQ9QZD5 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChmlQ9QZD5 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChmlQ9QZD5 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChmlQ9QZD5 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChmlQ9QZD5 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChmlQ9QZD5 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChmlQ9QZD5 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChmlQ9QZD5 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChmlQ9QZD5 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChmlQ9QZD5 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChmlQ9QZD5 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChmlQ9QZD5 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ChmlQ9QZD5 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ChmlQ9QZD5 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChmlQ9QZD5 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChmlQ9QZD5 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChmlQ9QZD5 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChmlQ9QZD5 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChmlQ9QZD5 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChmlQ9QZD5 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChmlQ9QZD5 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ChmlQ9QZD5 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ChmlQ9QZD5 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ChmlQ9QZD5 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ChmlQ9QZD5 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ChmlQ9QZD5 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ChmlQ9QZD5 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ChmlQ9QZD5 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ChmlQ9QZD5 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ChmlQ9QZD5 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ChmlQ9QZD5 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ChmlQ9QZD5 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ChmlQ9QZD5 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ChmlQ9QZD5 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ChmlQ9QZD5 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ChmlQ9QZD5 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ChmlQ9QZD5 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ChmlQ9QZD5 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ChmlQ9QZD5 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ChmlQ9QZD5 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ChmlQ9QZD5 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ChmlQ9QZD5 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ChmlQ9QZD5 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ChmlQ9QZD5 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ChmlQ9QZD5 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ChmlQ9QZD5 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms