Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ubxn8Q9QZ49 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ubxn8Q9QZ49 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ubxn8Q9QZ49 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ubxn8Q9QZ49 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ubxn8Q9QZ49 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ubxn8Q9QZ49 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ubxn8Q9QZ49 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ubxn8Q9QZ49 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ubxn8Q9QZ49 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ubxn8Q9QZ49 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms