Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ29

Igbp1b, Immunoglobulin-binding protein 1b, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igbp1bQ9QZ29 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Igbp1bQ9QZ29 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Igbp1bQ9QZ29 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Igbp1bQ9QZ29 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Igbp1bQ9QZ29 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Igbp1bQ9QZ29 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Igbp1bQ9QZ29 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Igbp1bQ9QZ29 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Igbp1bQ9QZ29 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Igbp1bQ9QZ29 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Igbp1bQ9QZ29 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Igbp1bQ9QZ29 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Igbp1bQ9QZ29 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Igbp1bQ9QZ29 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Igbp1bQ9QZ29 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Igbp1bQ9QZ29 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Igbp1bQ9QZ29 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Igbp1bQ9QZ29 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Igbp1bQ9QZ29 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Igbp1bQ9QZ29 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Igbp1bQ9QZ29 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Igbp1bQ9QZ29 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Igbp1bQ9QZ29 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Igbp1bQ9QZ29 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Igbp1bQ9QZ29 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Igbp1bQ9QZ29 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Igbp1bQ9QZ29 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Igbp1bQ9QZ29 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Igbp1bQ9QZ29 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Igbp1bQ9QZ29 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Igbp1bQ9QZ29 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Igbp1bQ9QZ29 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Igbp1bQ9QZ29 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Igbp1bQ9QZ29 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Igbp1bQ9QZ29 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Igbp1bQ9QZ29 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Igbp1bQ9QZ29 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Igbp1bQ9QZ29 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Igbp1bQ9QZ29 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Igbp1bQ9QZ29 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Igbp1bQ9QZ29 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Igbp1bQ9QZ29 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Igbp1bQ9QZ29 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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Igbp1bQ9QZ29 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Igbp1bQ9QZ29 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Igbp1bQ9QZ29 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Igbp1bQ9QZ29 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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Igbp1bQ9QZ29 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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Igbp1bQ9QZ29 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Igbp1bQ9QZ29 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Igbp1bQ9QZ29 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Igbp1bQ9QZ29 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
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Igbp1bQ9QZ29 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
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Igbp1bQ9QZ29 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Igbp1bQ9QZ29 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Igbp1bQ9QZ29 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Igbp1bQ9QZ29 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Igbp1bQ9QZ29 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Igbp1bQ9QZ29 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Igbp1bQ9QZ29 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
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Igbp1bQ9QZ29 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Igbp1bQ9QZ29 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Igbp1bQ9QZ29 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Igbp1bQ9QZ29 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Igbp1bQ9QZ29 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Igbp1bQ9QZ29 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Igbp1bQ9QZ29 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Igbp1bQ9QZ29 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Igbp1bQ9QZ29 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Igbp1bQ9QZ29 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Igbp1bQ9QZ29 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Igbp1bQ9QZ29 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Igbp1bQ9QZ29 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Igbp1bQ9QZ29 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Igbp1bQ9QZ29 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Igbp1bQ9QZ29 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Igbp1bQ9QZ29 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Igbp1bQ9QZ29 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Igbp1bQ9QZ29 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Igbp1bQ9QZ29 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Igbp1bQ9QZ29 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Igbp1bQ9QZ29 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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